國家基因庫發(fā)起“千種魚轉(zhuǎn)錄組計劃”

11月19日，深圳國家基因庫宣布“千種魚轉(zhuǎn)錄組計劃”（Fish T1K）正式啟動。該項目旨在解密魚類起源、進化、生殖、發(fā)育、性別調(diào)控和免疫等活動機制，以更好應(yīng)對魚類育種、疾病防控、海洋食品安全和生物多樣性保護等帶來的諸多挑戰(zhàn)。項目計劃在未來3～5年內(nèi)完成約1000種魚類轉(zhuǎn)錄組的測序、組裝工作，并構(gòu)建高質(zhì)量的魚類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息平臺。

相對于其他魚類轉(zhuǎn)錄組研究，千種魚轉(zhuǎn)錄組計劃規(guī)模大、學(xué)科交叉廣、綜合性強，在范圍內(nèi)尚屬*。

該項目產(chǎn)出的所有數(shù)據(jù)將通過國家基因庫公開，以保證科學(xué)家可以實時掌握魚類研究動態(tài)及RNA-seq測序技術(shù)的應(yīng)用。

據(jù)介紹，到目前為止，僅有約10種魚類的基因組被公開報道。此外，在NCBI公共數(shù)據(jù)庫中僅有80多種魚類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。

國家基因庫海洋分庫負(fù)責(zé)人、該項目帶頭人孫穎認(rèn)為：“T1K項目將建立*專門針對魚類組學(xué)研究的性合作網(wǎng)絡(luò)，并將大大深化我們對魚類的比較生理學(xué)、生物地理學(xué)認(rèn)識，促進魚類資源醫(yī)用價值的挖掘、經(jīng)濟和生態(tài)價值的開發(fā)，以及生物多樣性保護等問題的解決。”

《中國科學(xué)報》 （2013-11-21 第1版 要聞）